A genética desempenha um papel significativo na composição do microbioma.1 Os microbiomas intestinais de cães geneticamente relacionados foram mais semelhantes entre si do que em cães não relacionados, apesar da separação geográfica após o desmame.2
A colonização microbiana do trato intestinal é primeiramente influenciada pelo microbioma materno, ambiente e nutrição.
Os microbiomas dos filhotes eram mais semelhantes aos microbiomas de suas mães às 7 semanas de idade em comparação com sua composição no nascimento.2 O microbioma intestinal de filhotes aumenta em diversidade microbiana e riqueza de espécies de 2 a 56 dias após o nascimento, mas é relativamente estável em 42 dias após o nascimento.3 Em contraste, os filhotes de gatos podem apresentar uma redução na diversidade em 4 a 8 semanas de idade.4
Um estudo de metagenômica sugeriu que o microbioma dos filhotes de gatos sofre poucas mudanças entre 8 e 16 semanas,5 e um estudo separado observou mudanças na diversidade estrutural e funcional entre 18 e 30 semanas de idade, mas nenhuma mudança significativa de 30 a 42 semanas.6
Com a idade, doenças, tratamentos médicos e outros estressores, o equilíbrio das bactérias no intestino pode mudar para populações maiores de bactérias potencialmente patogênicas.3,7,8
O ambiente de vida do animal de estimação também pode afetar dramaticamente a microbiota intestinal. Os microbiomas dos cães que vivem em domicílios diferem daqueles que vivem em abrigos, com os cães de abrigo apresentando uma população de microbiomas mais diversificada.1 Cães que vivem em cidades maiores mostram um microbioma mais diversificado do que aqueles em cidades menores ou em ambientes rurais.2
Vários estados de doença estão associados à disbiose do microbioma intestinal, embora não tenha sido definitivamente determinado se a disbiose é a causa ou uma consequência do estado da doença.1
A disbiose foi encontrada em cães com enteropatias crônicas, diarreia crônica e diarreia aguda.9,10
Os medicamentos podem afetar o microbioma.
Antimicrobianos em particular (como metronidazol e tilosina) podem alterar profundamente o microbioma.1,11,12 Os inibidores da bomba de prótons, como o omeprazol, também exercem efeitos negativos sobre o microbioma.1,13
A obesidade está associada a alterações no microbioma, mas o papel do microbioma como causa ou consequência da obesidade permanece desconhecido.14,15
O microbioma de cães obesos responde de forma diferente à dieta e é menos resiliente do que o microbioma de cães magros.15,16
A composição da microbiota intestinal é amplamente afetada pela dieta.
O microbioma pode ser afetado pelo perfil de ingredientes, concentrações de nutrientes e digestibilidade e procedimentos de processamento da dieta.17-24 A composição de macronutrientes parece ser o fator dietético mais significativo que leva a mudanças na composição do microbioma.17,24-29 Dietas ricas em proteínas aumentam a abundância de micróbios proteolíticos, enquanto dietas ricas em carboidratos aumentam a abundância de micróbios sacarolíticos.23
O microbioma intestinal muda rapidamente em resposta à dieta,17,30,31 indicando grande flexibilidade em sua composição. No entanto, essas mudanças são reversíveis e o microbioma voltará à sua composição original quando os cães retornarem à sua dieta original.30,31