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Métagénomique
Les microorganismes jouent des rôles importants dans la santé des animaux. Des milliers de milliards de microbes présents dans le tractus intestinal créent des réseaux moléculaires ayant des effets sur l'ensemble du corps, y compris sur la digestibilité des nutriments, la santé intestinale, la santé du cerveau, la fonction immunitaire et l'espérance de vie.
Par le passé, les chercheurs étudiaient une espèce ou une souche de microbes à la fois. Avec la métagénomique, les scientifiques de Purina utilisent des technologies avancées de séquençage de l'ADN qui étudient simultanément des milliers de microorganismes pour mieux comprendre les interactions complexes qui ont un impact sur la santé.
La métagénomique montre que les microbes peuvent rivaliser avec les génomes quant à leur impact sur la santé. Cependant, contrairement aux génomes, les microbiomes sont affectés par les changements alimentaires. À l'avenir, la gestion des microbes par l'alimentation permettra non seulement d'optimiser la santé intestinale, mais aussi la santé physique et mentale globale.
La recherche chez Purina
Les scientifiques de Purina ont fait partie des premiers à appliquer le pyroséquençage, une technique d'analyse rapide de l'ADN, dans l'étude des microbiomes.
Lors d'une étude, les chercheurs ont extrait l'ADN des selles de chats atteints de diarrhée chronique afin d'identifier les populations bactériennes dans le microbiome du tractus gastro-intestinal inférieur1.
L'amélioration de la qualité des selles a coïncidé avec des changements dans la population microbienne.
Au début de l'essai clinique, les chats souffraient d'une diarrhée chronique et leurs selles étaient de type 6 ou 7. À mesure que les essais sur le régime alimentaire progressaient, près de 50 % des chats ont vu la qualité de leurs selles s'améliorer, passant à un type 3 ou inférieur selon le tableau des selles de Purina1,2.
Alors que la diarrhée chronique des chats s'améliorait au cours de l'étude grâce aux changements alimentaires introduits, trois populations bactériennes prédominantes étaient également affectées de manière significative. Ces résultats suggèrent que ces bactéries peuvent jouer un rôle important dans la santé intestinale.
Points clés à retenir
- Les microbiotes intestinaux peuvent rivaliser avec le génome en matière d'impact sur la santé.
- Les approches métagénomiques permettent aux scientifiques d'étudier simultanément des milliers de microbiotes intestinaux afin de mieux comprendre leur impact sur la santé et les maladies.
- La population microbienne de l'intestin peut évoluer en fonction des maladies et des changements alimentaires, ce qui suggère la possibilité d'améliorer la santé grâce à des interventions nutritionnelles.
En savoir plus
1. Ramadan, Z., Xu, H., Laflamme, D., Czarnecki-Maulden, G., Li, Q. J., Labuda, J., & Bourqui, B. (2014). Fecal microbiota of cats with naturally occurring chronic diarrhea assessed using 16S rRNA gene 454-pyrosequencing before and after dietary treatment. Journal of Veterinary Internal Medicine, 28(1), 59–65.
2. Laflamme, D. P., Xu, H., Cupp, C. J., Kerr, W. W., Ramadan, Z., & Long, G. M. (2012). Evaluation of canned therapeutic diets for the management of cats with naturally occurring chronic diarrhea. Journal of Feline Medicine and Surgery, 14, 669–677.